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WB实验中蛋白跑带如何区分分子量大小

更新时间2018-03-12 06:28:47

western blot中分离胶浓度的选择取决于目的蛋白分子量 不同的分离胶浓度对不同的目的蛋白分子量的分辨率不一样,比如15%的分离胶更适合45kDa的分目的蛋白,而10%的分离胶更适合70kDa的目的蛋白而因为western blot的膜应该是完全覆盖SDS PAGE的凝胶,所以不用太担心条带在凝胶上位置偏上活偏下 所以western blot中分离胶浓度的选择取决于目的蛋白分子量

如果以溴酚蓝跑到胶的底部为准,26kD在10%的由下往上1/4的地方,而15%就在由下往上大约1/2(不太确定)的地方,对于分子量比较小的蛋白,当然是胶的浓度越大,分离效果越好.但是你必须考虑到,胶的孔径一旦小于蛋白-SDS复合体的直径,分子量大于这个蛋白的所有蛋白仍然不能有好的分离效果.如果孔径太大,所有蛋白都跑得那么快,也是分不开的.所以,关键是看这个分子量附近的蛋白,比如±5kD以内的所有蛋白,在不同浓度的胶中的速度差要尽可能达到最大,假设是对数正态分布,那么方差要足够大,才会有较好的分离效果.另一方面,蛋白跑的路程越大,也越能和附近的蛋白分开.

建议是溴酚蓝跑到底,而目标蛋白正好在整块胶的1/2的地方,分离的效果时最好的

分子量较大的蛋白做wb实验和其他蛋白并没有什么特别的不同主要注意几个地方合适的内参印染,一般用的比较多的几种内参分子量都比较小(30~50KD)合适的凝胶,胶浓度要配制的稀一些,一般选择3%~10%的凝胶增加转膜时间,分子量较大的蛋白要完全转到膜上需要更长的时间

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